Análise de qualidade e quantificação de diversos tipos de DNA e RNA.Preparo de diferentes tipos bibliotecas de DNA e RNA para sequenciamento na plataforma Illumina.Preparo de Array BeadChip para metilação e SNP Illumina.Quantificação de bibliotecas por diferentes métodos (fluorimétrico, eletroforese e qPCR).Sequenciamento em plataformas Illumina (MiSeq, NextSeq 550, NextSeq 2000 e NovaSeq 6000).Análise de dados de bioinformática e construção de VCFs.Análise de dados de sequenciamento em pesquisa (anotações de variantes).Alimentação de banco de dados SELAdb.

Bolsista ETAPA do laboratório estratégico/centro de respostas rápidas, atuando com diversas técnicas de biologia molecuar:A) Sequenciamento de nova geração, plataforma Illumina (MiSeq, e NextSeq1000), IonTorrent (Ion GeneStudio S5 System Prime) e MinION (Oxford Nanopore).B) Produção de bibliotecas genômicas e de amplicons (humanas, virais e bacterianas).C) Extração de ácidos nucleicos (isolados e de amostras humanas), kits manuais e automatizados.D) Gerenciamento de qualidade de DNA/RNA, E-gel, Nanodrop e Quibit (Thermo Fisher).E) Uso de automações: JANUS G3 Workstations (Perkin Elmer), Zephyr® G3 (Perkin Elmer), EXTRACTA STATION 9600 (Loccus).F) Diagnóstico laboratorial por Real Time PCR (COVID, Pneumonias bacterianas, MonkeyPox e Influenza).G) Sequenciamento Sanger, 3500 Series Genetic Analyzer e 3500 Series XL (Applied Biosystems).H) Análise de dados utilizando diversas ferramentas de Bioinformática.

Colaborador do projeto: Pesquisa de novos marcadores genotípicos com vistas à padronização de um ensaio de PCR em tempo real para detecção de E. coli produtora de toxina shiga em materiais diversos. Descrição sumária das atividades exercidas:A) Isolamento de bactérias enteropatogênicas e sua caracterização bioquímica e molecular.B) Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE).C) PCR convencional e multiplex.D) PCR em tempo real.E) Sequenciamento pelo método de Sanger, Multi Locus Sequence Typing (MLST).F) Softwares utilizados para análises: Bionumerics, Bioedit e Chromas.

Colaborador do projeto: Rt-PCR em tempo real (RT-qPCR) para diagnóstico antemortem de raiva humana.Descrição sumária das atividades exercidas:A) Extração de RNA total pelo método TRIZOL®.B) Transcriptase reversa (RT-PCR), PCR convencional, Hemi-Nested PCR.C) Eletroforese em gel de agarose.D) Purificação do produto da PCR por kit, purificação da reação de sequenciamento de DNA por gel Sephadex.E) Sequenciamento pelo método de Sanger.F) Análises utilizando os softwares Bioedit e Chromas.G) Design de primers utilizando o software Primer Express®.

Programa de aprimoramento profissional (FUNDAP) realizado no núcleo de doenças entéricas pelo programa técnicas sorológicas e moleculares para diagnóstico das gastroenterites virais e enteroviroses de importância em saúde pública.Descrição sumária das atividades exercidas:A) Esterilização desinfecção, preparo de reagentes e soluções.B) Recebimento e registro de material clínico para o diagnóstico laboratorial dos vírus entéricos e do programa de vigilância estadual das paralisias flácidas agudas/poliomielite.C) Noções para o preparo de culturas celulares.D) Noção sobre o registro informatizado (banco de dados) das informações epidemiológicas.E) Preparo de sub-culturas celulares, clarificação de suspensão de fezes (inóculo) para isolamento dos enterovírus em cultura de células (linhagens: RD, MRC-5, Hep-2, Vero).F) Pesquisa de anticorpos por microsoroneutralização.G) Ensaio imunoenzimático (ELISA), eletroforese em gel de poliacrilamida (SDS-PAGE) para análise sorológica e gênica dos rotavírus.H) Extração de RNA dos rotavírus, norovírus e enterovírus pelo método TRIZOL® e por kit QIAamp Viral RNA Mini Kit.I) Rt-PCR para genotipagem dos rotavírus, norovírus e enterovírus, Semi-Nested PCR para rotavírus, eletroforese em gel de agarose para análise dos resultados.J) Rt-qPCR One Step para detecção dos enterovírus.K) Sequenciamento viral, purificação do produto da PCR (dsDNA) método PureLink™ PCR Purification, reação de sequenciamento Cycle Sequencing (método de Sanger), precipitação do produto do Cycle Sequencing método de coluna CentriSep.L) Noções de métodos em bioinformática para análise de sequenciamento dos enterovírus (BioEdit, Chromas).

Aprimoramento nos setores de bioquímica, coleta de materiais biológicos, hematologia, imunologia, microbiologia e urinálise no laboratório de análises clínicas do Hospital Evangélico de Sorocaba, atuando na rotina diagnóstica e emergência, desde a fase pré-analítica a pós-analítica.

Bolsista da Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP).

Estagiário no laboratório de vírus exercendo atividades na área de biologia molecular, onde foram realizadas extrações de DNA (Kit Extração Mini Spin Plus, Biopur), técnicas de PCR e nested PCR, leitura de gel de agarose, auxílio na organização de materiais e do laboratório em geral, interpretação dos resultados obtidos, análises para estudo e caracterização de doenças virais em pacientes imunodeprimidos, incluindo transplantados, com doenças autoimunes, neonatos e aqueles que fazem uso de quimioterapia.