L'objectif du projet de thèse est d’explorer des solutions originales de diagnostic à très bas coût, de type microfluidique papier, sur le modèle arbovirus chikungunya principalement, ainsi que les virus dengue et Zika. Les solutions proposées (détection des antigènes viraux et sérologie IgM) sont évaluées en termes de performances cliniques et en termes de faisabilité pour la stratification des patients présentant des symptômes récents de fièvre indifférenciée avec céphalée, dans les régions… Show more L'objectif du projet de thèse est d’explorer des solutions originales de diagnostic à très bas coût, de type microfluidique papier, sur le modèle arbovirus chikungunya principalement, ainsi que les virus dengue et Zika. Les solutions proposées (détection des antigènes viraux et sérologie IgM) sont évaluées en termes de performances cliniques et en termes de faisabilité pour la stratification des patients présentant des symptômes récents de fièvre indifférenciée avec céphalée, dans les régions de transmission de ces maladies, notamment les pays en voies de développement. Elles permettront également de mieux adapter les traitements. Ce projet répondra donc à des objectifs de recherche appliquée à un problème de santé publique (diagnostic médical) et à des objectifs plus fondamentaux sur l’étude d’agent viraux émergents dans les pays en voie de développement.Compétences acquises :• Enzyme Linked ImmunoSorbent Assay (ELISA) et Enzyme Linked Aptamer Sorbent Assay (ELASA) pour screening et caractérisation de matières premières biologiques (sérums humains, anticorps, antigènes viraux, peptides...).• Micro-fluidique papier : design et fabrication de "patterns" microfluidiques pour du diagnostic de protéines virales et d'anticorps anti-viraux, et amélioration de la sensibilité/spécificité de détection de la technologie mise au point.• Analyses en spectrométrie de masse (Q-TOF) pour caractérisations de peptides synthétique viraux par Peptide Mass Fingerprinting (PMF). • Interférométrie (Bio-Layer OCTET) afin d'analyser les spécificités des matières premières pour les antigènes à détecter. Show less

Tests et sélection d'anticorps monoclonaux pour la détection de germes bactériens pathogènes de l'Homme, présents dans l'eau, sur l'appareil VIDAS de bioMérieux.• Utilisation de l'appareil d'immunoassay VIDAS de bioMérieux.• Enzyme Linked Fluorescent Assay (ELFA).• Manipulations en laboratoire de sécurité niveau P2.• Culture cellulaire (procaryote).• Élaboration de tampons d'élution, de milieux gélosés sélectifs et chromogéniques.• Compte-rendus d'activités.

Travail sur la technologie BacVac (entreprise APCure) : utilisation du système de sécrétion de type III de Pseudomonas aeruginosa comme moyen de vaccination.• Manipulations en laboratoire de sécurité niveau P2.• Tests de sécrétion et d'injection de protéines dans des cellules eucaryotes via P. aeruginosa.• Électrophorèses et Western-Blot.• Visualisation via microscopie à fluorescence des cellules contaminées.• Culture cellulaire (eucaryote et procaryote).• Cytométrie… Show more Travail sur la technologie BacVac (entreprise APCure) : utilisation du système de sécrétion de type III de Pseudomonas aeruginosa comme moyen de vaccination.• Manipulations en laboratoire de sécurité niveau P2.• Tests de sécrétion et d'injection de protéines dans des cellules eucaryotes via P. aeruginosa.• Électrophorèses et Western-Blot.• Visualisation via microscopie à fluorescence des cellules contaminées.• Culture cellulaire (eucaryote et procaryote).• Cytométrie en flux avec utilisation de tétramères synthétiques.• Travail sur souris de laboratoires. Show less

Création et mise en fonction d’un prototype d’épuration des eaux usées par les roseaux.• Fabrication d'un prototype d'épuration avec analyses biochimiques et microbiologiques de l'eau (en entrée et en sortie d'usine).• Correspondance des résultats obtenus à des normes préétablies.• Connaissance du circuit d'épuration des eaux usées.• Travail en laboratoire.• Participation à la vie sur la station.• Présentations de résultats et réunions d'équipes.