Mathilde Daures Email & Phone Number

Vitry-Sur-Seine

Application Delivery Manager for CMC and Vaccines Service.IT Project Leader

Région De Paris, France

Mission : Identification de gènes à contribution monogénique dans le diabète via l'analyse de données de séquençage d'exomes humains - Automatisation du processus via une intégration systématique des données dans un pipeline d'analyse bioinformatiqueRéalisations: - Développement d'un pipeline d'analyse de données de séquençage d'exome permettant l'annotation des variants, le filtrage des variants, la recherche d'informations complémentaires sur les variants et les gènes porteur des ces variants, un classement des variants selon leur pathogénicité et leur relation avec la pathologie et la comparaison des variants entre individus- Encadrement d'un étudiant pour la réalisation de l'interface graphique de l'application- Rédaction de la documentation de l'application- Formation des utilisateurs à l'utilisation de l'application- Analyses informatiques avec l'application de plus de 200 résultats de séquençage d'exome humains sélectionnés- Analyses des résultats issus de l'application et sélection de gènes candidats- Identification de nombreux gènes responsables de diabètes atypiques (avec quelques extensions des phénotypes connus)- Identification de deux nouveaux gènes de diabèteDomaine et informations techniques :Génétique HumaineDiabèteSéquençage haut-débit - Séquençage d'exomePython - Biopython - SqlAlchemy - PyQtMySQLbash

Région De Paris, France

Mission : Mise en place d'un pipeline d'analyse de données de séquençage haut débit pour l'identification des gènes responsables de diabètes atypiques monogéniquesRéalisations :- Création d'un pipeline d'analyse pour le filtrage de fichiers de données de séquençage d'exome- Etude des résultats de séquençage d'exome et sélection de gènes candidatsDomaine et informations techniques :Génétique HumaineDiabèteSéquençage haut-débit - Séquençage d'exomePython

Improve, edit and create online tools for biological analysis. PHP/Perl and MySQL for databases

Performed preliminary study of tools and data for integrative analysis of high throughput data. Created Data-morphing module and pipeline. Organized and managed meeting with academic partners to define their needs.

Performed specifications for open source software replacing the software ALAMUT ®, (DNA, RNA and proteins analysis software).

Studied the random nature of mutations in SOS induced population of Escherichia coli. Performed construction of fluorescent SOS reporter.

Organized product launch event

Doctor Of Philosophy (Phd), Bioinformatique, Mention Très Honorable Avec Félicitations Du Jury

Master, Comptutational Biology, Mention Bien

Bioinformatique Génomique Bioinformatique Structurale Bioinformatique Systémique

Expert En Ingénierie Des Biotechnologies, Biotechnologies, Mention Très Honorable Avec Félicitations Du Jury

Activities and Societies: Vice Présidente du Bureau des Élèves (2009-2010)

Licence, Chimie Biologie

Bac, Scientifique, Mention Bien