陳佩英自2003年起先於私立華梵大學、國立清華大學服務，2008年起則轉至國立臺灣師範大學教育系暨教育政策與行政研究，服務至今。於研究部分，在中小學的政策與行政領域，陳佩英以學校領導(校長、教師、分散性)和實踐社群(教師專業學習社群)為主軸，深入探討並嘗試找出蘊含主體培力行動意義的學校與教育變革路徑；在大學領域，則是持續探究大學教授的性別和領導議題，特別關懷新管理主義脈絡下的變化情形。八年來所從事的領導、學習系列研究，主要圍繞在「結構—行動」的辯證關係中開展，從理論旨趣出發，具體化為教育實踐中的重要問題。未來也將延續和整合教師培力、分散式的教師領導、和活動理論之研究旨趣，把焦點從專業學習社群(PLC)，延伸至網絡學習社群(networked learning communities)，再進一步透過跨國比較，深入探討變革如何可以透過學校間、大學和地方教育局之合作，進行校際間和教育系統跨組織學習、教學資源交流和共享教育目標，並以研究為導向，引導跨組織建立網絡學習社群，在第三空間中進行教育學想像和實驗，尋求機會開展蘊含集體智慧的創新行動。教學部分則是以比較教育、教師領導、專業學習社群、組織變革、新制度論和建制學習、教師社會學、社會學理論、和社會研究方法等。在服務部分，自2007年起接受教育部的委託，和將近30位的學者和校長一起負責推動高中優質化輔助方案至今。目前服務的高中已超過300多所。由於2006年參與高瞻計畫，發現專業學習社群對於教師專業成長和課程與教學創新確實帶來實質紮根和持續的效益，將此發現用於優質化方案之推動，並自2009年起與校長一起設計初階和進階專業學習社群工作坊，協助各校教師組成社群，一起學習和一起領導。初步成果編纂成《從心學習：聽專業學習社群老師說故事》；又因獲得國教署的支持，高中優質化方案的執行初步成果集結成冊《高中優質化藍海航程紀實》，好讓社會大眾了解高中第一線工作者所投入的努力。2013年則協助台北市領先計畫的初期規劃和執行。2012年-2015年，為台北市和新北市學校領導與未來領導人才工作坊設計和執行課程，和兩市的多位校長、主任及NPO異業合作，開展學校領導專業發展的新模式。課程的內涵包括、黑暗中對話(NPO)、趨勢想像(NPO)、系統思考與策略思考、設計思考、組織記憶和教師動能，藉由學習活動設計、例如圖片故事、棉花糖挑戰、養牛賺大錢、高麗菜翻幾番、傳球挑戰、紙卡策略規劃等，以完成任務和成果為導向，透過小組合作激盪和經驗反思打破舊有框架，讓新思維和想望從隙縫中升起，在藉由團體動力，強化所學。專業學習社群和學校領導人才培育之經驗皆有撰寫成相關論文和專書，供有興趣者參考。2015年3月赴芬蘭赫爾辛基大學活動發展與學習研究中心（Center for Research on Activity, Development and Learning, University of Helsinki)，參與一週的變革實驗室課程培訓，所學內容轉成學校組織變革作坊內容，繼續協助校長、主任等之學校領導增能課程，也將用於校本組織變革動能之催化工具。