Raphaël Léonard Email & Phone Number

Bioinformaticien de formation, le sujet de mon mémoire puis de ma thèse a été la déréplication de génomes bactériens, càd de trouver trouver les génomes redondants, de les regrouper et de réduire chaque groupe à un seul représentant tout en préservant les génomes bactériens non redondants uniques. La création d'un outil automatisé qui remplit cet objectif, et baptisé ToRQuEMADA, a requis une utilisation du langage de programmation Perl, de créer une base de données (MySQL) puis d'interagir avec cette base de données via Perl. Les tests pour vérifier l'efficacité ont nécessité une utilisation de Perl, de la ligne de commande sous linux (bash) et du langage de programmation R. Un article scientifique sur le sujet est en préparation. Le reste de ma thèse a été dédié à la phylogénomique bactérienne ainsi qu'à des collaboration avec d'autres doctorants (plus de renseignements sur la plate-forme ORBi: https://orbi.uliege.be/ via la recherche sur Léonard Raphaël dans la catégorie auteurs).